飞秒激光手术有一定的危害，具体要靠专业的眼科检查决定。大概可分为以下几点：
1、手术是在角膜上进行一定的激光的切削，对角膜一定会造成结构上的破坏，手术以后可能会出现角膜的感染问题。
2、在角膜上进行激光的切削，角膜的结构形态会受到一定的影响。将来如果眼睛受到一些外伤，比如打击或者震动的时候，角膜是处在相对薄弱的状态，就容易受到一些伤害。
3、术后常见的并发症，比如角膜的上皮下的一些弥漫性的混浊或者是角膜上皮的层间的植入等等，会导致角膜出现混浊、炎性的问题，就会影响视力。
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