鼻涕的颜色不同是因为感染的细菌不同，黄色一般是金黄色葡萄球菌感染，绿色一般是绿脓杆菌感染。
健康人鼻腔内面衬着完整的一层粘膜，上面分布着很多具有分泌功能的杯状细胞，粘膜下有粘液腺，它们平时不断进行分泌活动，分泌的水分用于湿润吸入空气，另外，粘液腺还经常分泌少量的粘液，均匀的分布在粘膜表面。吸附吸入空气中的灰尘和微生物。粘液中还含有溶菌酶，有抑制和溶解细菌的能力。这种粘液就是鼻涕。
正常的鼻涕是无色透明的，也就是所谓清鼻涕。感冒时一开始流出的也是清鼻涕，之后鼻涕会变得浓一些，成了白色。再往后流出的就可能是绿色的浓鼻涕了，如果继发了细菌感染，更是如此。
之所以会这样，是因为它含有大量的嗜中性粒细胞。嗜中性粒细胞虽然属于白细胞，却是绿色的。免疫系统发现有病原体入侵人体时，开始调兵遣将，嗜中性粒细胞是被血液送来的，但是它却跑到血管之外作战。它是一种吞噬细胞，它的作战方式是把细菌“吃”进去，在细胞里用各种武器将病原体杀死。武器之一是向细菌释放消毒剂——次氯酸
次氯酸是由嗜中性粒细胞内的髓过氧物酶制造的，髓过氧物酶的结构和叶绿素有个共同点，都含有二氢卟酚环，这个特殊结构决定了它们的颜色：绿色。因此，浓鼻涕会是绿色的，是因为它含有很多嗜中性粒细胞，而嗜中性粒细胞又含有很多绿色的髓过氧物酶。