持股比例是根据股东出资额占公司注册资本金的比例计算出来的。例如公司本来注册资本金为90万，股东出资10万，那该股东持股比例就是10/（90+10）也就是占比10%。但是股东之间或者公司章程另有约定的除外。
《中华人民共和国公司法》
第二百一十六条
本法下列用语的含义：
（一）高级管理人员，是指公司的经理、副经理、财务负责人，上市公司董事会秘书和公司章程规定的其他人员。
（二）控股股东，是指其出资额占有限责任公司资本总额百分之五十以上或者其持有的股份占股份有限公司股本总额百分之五十以上的股东；
出资额或者持有股份的比例虽然不足百分之五十，但依其出资额或者持有的股份所享有的表决权已足以对股东会、股东大会的决议产生重大影响的股东。
（三）实际控制人，是指虽不是公司的股东，但通过投资关系、协议或者其他安排，能够实际支配公司行为的人。