无创DNA本身是自费项目，需要自己交费。
如果检测呈阳性并最终确证，治疗过程中的一些费用有可能可以报销，这种情况应该是后期与医院的治疗有关，是后期应该咨询医院的问题。
另外有的无创DNA有引入商业保险，取决于保险细则，如以下为真实细则（不同保险细则不尽相同）：
若21、18、13染色体三体型检测结果为阳性或高风险，其他染色体检测结果异常，被保险人接受产前诊断的所产生的医疗费用，如羊水穿刺，经皮脐静脉穿刺术，染色体核型分析及染色体荧光原位杂交（FISH），由中国人寿按照约定给予被保险人报销，最高给付人民币2500元，对该保险人保险责任终止。
若21、18、13三体型检测结果为阴性或低风险，被保险人所生育的婴儿在出生后一年内经省市级专科医生采用染色体核型分析明确诊断患有“21、18、13染色体三体型”疾病，同时经亲子鉴定确认患儿为孕妇的亲生子女，中国人寿根据保险合同约定给付被保险人保险金40万元整，对该保险人保险责任终止被保险人也不得再向我公司追索任何其他费用。