截止2019年4月，《圣斗士星矢》一共16部，其中剧场版5部。
1、银河战争篇
讲述故事发生的十三年前，一名黄金圣斗士艾俄洛斯抱着一个女婴跑出圣域，这女婴便是雅典娜。艾奥罗斯被杀，一切由此而起。主角星矢连同其馀青铜圣斗士为保护雅典娜而展开激战。
2、教皇刺客篇
讲述来自圣域的杀手杜拉狄斯突然出现，一辉为了大家的安全，使出凤翼天翔，杜拉狄斯、一辉与及黄金圣衣除头部外的其他部份，都消失于地裂之中。可是杜拉狄斯并没有死去，他来到城户家捉走了城户沙织，要胁众人要拿出黄金圣衣的头罩来交换。
3、黄道十二宫篇
讲述穿上了人马座黄金圣衣的星矢仍然不是艾奥里亚的敌手，幸得沙织以女神的身份出现，再加上艾奥罗斯的灵魂帮助星矢，艾奥里亚终于明白真相，返回圣域找亚历士算帐。到最后，米罗终于知道他们保护的乃是真正的雅典娜，所以点了冰河的真央点，恢愎冰河的五感。
4、北欧仙宫篇
讲述身为北欧亚斯格特之神奥汀的地上代行者希露达，受到黄金戒指魔力的影向，由以前善良的少女变成现在一心要占领圣域的邪恶女王。她唤醒了传说中的七个神斗士，并向圣域挑战。于是星矢他们再一次出发，远赴极北之地亚斯格特。
5、海皇神殿篇
讲述支配海界的海皇波士顿，为了要肃清大地，竟不断降下豪雨，希望能以大海啸、大洪水把人类淹灭，从而建立一个神的理想世界。他更把雅典娜掳去，要求一起统治新的世界，但为女神所拒绝。雅典娜为了延迟地上被海水淹没，自愿当上大黑柱的生祭品。
6、冥王十二宫篇
讲述在遥远的神话时代，冥王哈迪斯曾率领108冥斗士向人类世界发起攻击，智慧女神雅典娜则率圣斗士们奋起迎敌。连番苦战之后，哈迪斯及其军团战败，他们全部被雅典娜封印，而圣斗士也几乎损伤殆尽。数千年后，圣斗士刚刚结束与海王波塞冬的苦战。
7、冥王冥界篇
圣斗士星矢冥王篇讲述的是雅典娜的圣斗士与海皇一战后，与冥王哈迪斯进行新的战斗。冥王哈迪斯的真身便藏在此处，雅典娜也被困于此。
8、冥王极乐净土篇
讲述星矢等人在通过叹息之墙后，到达极乐净土的故事。极乐净土据说是只有生前心灵纯洁的人，在死后才能到达的地方。星矢等人将再次创造奇迹，救出雅典娜。
9、圣斗士星矢：黄金魂（外传）
讲述穿越悠远时光，为了守护地上的爱及和平，十二位黄金圣斗士再次复苏！于冥界与哈迪斯军的战役之中，十二位黄金圣斗士为助星矢一行人突破重围，不惜牺牲自我生命，以凿穿叹息之墙，诺大谜团尚未厘清，却又被卷入战争的艾奥里亚。
10、圣斗士星矢Ω（后传）
讲述从神话时代到现代，每当有邪恶出现之时，正义的希望斗士·圣斗士必然会挺身而出。他们身穿名叫圣衣，为女神雅典娜而战。其中，数次救下雅典娜的青铜圣斗士·天马座星矢等人的友情与战斗的事迹为传说写下新的篇章。
11、圣斗士星矢：邪神艾莉丝（剧场版）
讲述善良的孤儿院女老师绘梨衣与孩子们过着平静的生活，但是她受到黄金苹果的召唤，化身为纠纷女神爱丽丝。为了实现毁灭世界的目的，她绑架了女神雅典娜，并用金苹果将其捆住。随同纠纷女神一同复活的还有矢座魔矢、天琴座奥菲斯等五位亡灵圣斗士。
12、圣斗士星矢：神与神之激战（剧场版）
讲述遥远的东西伯利亚，正在此地修炼的冰河，偶然救助一个被人追杀的男子。从他的口中，冰河得知北欧的神之大陆发生巨大变故，神与神的战争一触即发。在此之后，冰河神秘失踪，纱织小姐带领星矢等人拜访了神之大陆的教主多路巴，然而对方却不理他，神域之行一无所获。
13、圣斗士星矢：真红少年传说（剧场版）
讲述过了数千年，太阳神再次复活，回到地上。他还主动地找雅典娜，要求她一起统治新的世界。这时，星矢等人来到找沙织，却被太阳神的日冕圣斗士所阻止，而且阿贝尔更以神力使到在十二宫中死去的黄金圣斗士复活。
14、圣斗士星矢：最终圣战的战士们（剧场版）
讲述四道邪恶光辉侵入圣域，以迅雷不及掩耳之势击毙守护圣域十二宫的黄金圣斗士。来者乃圣魔天使，是堕落天使路西法的手下。神话时代，路西法试图支配全宇宙并凌驾创世神之上，最终被打入魔界，他怀着恐惧罪恶的念头苏醒，企图支配全宇宙，全宇宙的命运危在旦夕。
15、圣斗士星矢：圣域传说（剧场版）
讲述射手座黄金圣斗士艾欧洛斯怀抱真正的女神转世雅典娜逃出圣域，途中遭到双子座撒卡和摩羯座修拉的阻击身负重伤。命运的趋势下，垂危一线的艾欧洛斯将女神托付给刚好来喜马拉雅山脉探险的日本城户财团总裁城户光政。
16、圣斗士星矢：天界篇序章（剧场版）
讲述讲述冥界之战后，星矢、沙织等人与天界之上的神祗月神阿尔忒弥斯及太阳神阿波罗战斗的故事。
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【《圣斗士星矢》剧情结构】
TV版（114集）——
圣域篇 73集（银河战争篇15集、教皇刺客篇25集、黄道十二宫篇33集）
北欧仙宫篇 26集
海皇神殿篇 15集
OVA版（31集）——
冥王十二宫篇 13集
冥王冥界篇 12集
冥王极乐净土篇 6集
剧场版（5部）——
1.黄金苹果
2.神与神之战
3.真红少年的传说
4.最终圣战的战士们
5.天界篇·序奏
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详细内容——
银河战争篇
第1话：复活！英雄传说！
第2话：燃烧！天马流星拳
第3话：白鸟！冰原战士
第4话：天龙！无敌之拳与盾
第5话：奇迹的复活！友情的小宇宙
第6话：凤凰！地狱战士
第7话：争夺！黄金圣衣
第8话：打败！暗黑凤凰军团
第9话：强敌！暗黑四天王现身
第10话：紫龙危险！圣衣的坟墓
第11话：决战！恐怖的黑死拳
第12话：抓着！友情的星云锁
第13话：燃烧着！火一击
第14话：失败！幻魔拳
第15话：终於身世大白！一辉之谜
教皇刺客篇
第16话：巨大！杜拉狄斯之猛袭
第17话：拯救！沙织的危机
第18话：加勒比海之幽灵圣斗士
第19话：生与死的魔界岛血战
第20话：认真的决战！莎尔的反击
第21话：无情！师徒的对战
第22话：火中复活！不死身的一辉
第23话：白银圣斗士！超级刺客
第24话：天马飞翔！彗星的表现
第25话：战斗！女神雅典娜的真相
第26话：是敌是友！钢铁圣斗士
第27话：星矢变成石头！美杜莎之盾
第28话：天龙！拼命一击
第29话：诱拐！袭击沙织的乌鸦军团
第30话：燃烧着！爱的小宇宙
第31话：幻魔！生死线
第32话：大爆发！死亡皇后鸟
第33话：龙虎激战！天龙之泪
第34话：再见吧朋友！安静睡眠吧
第35话：生死之旅！张开天龙之眼
第36话：震惊！十二件黄金圣衣
第37话：面具的喊叫！是爱是死
第38话：激战！黄金圣斗士
第39话：光速！超光速的强拳
黄道十二宫篇
第40话：前进！我们的旅程
第41话：圣域大决战！雅典娜的最大危机
第42话：最终的小宇宙！第七感
第43话：大恶战！金牛宫的战斗
第44话：双子宫！光与黑的迷宫
第45话：恐怖！往异次元的漂流
第46话：吠叫！攻防一致的星云锁
第47话：再见冰河！勇者睡眠了
第48话：天龙！死之国苏醒
第49话：爱！春丽的祈?
第50话：升龙！紫龙愤怒的小宇宙
第51话：不明！无牙的黄金狮子
第52话：亚弥斯！传说的魔皇拳
第53话：男子汉！在爱中死去的卡西欧士
第54话：一辉！被拆去翼的凤凰
第55话：永远的友情！呼叫雅典娜
第56话：沙加！神一般之男
第57话：不存在的恐怖！张开眼睛的沙加
第58话：壮烈！友情消失的一辉
第59话：苏醒的白鸟！生、死、爱
第60话：冰河的复活！生命回复
第61话：是降是死！翼是有限制的
第62话：前进冰河！自豪光荣的勇者
第63话：响亮！圣域的黄金圣衣
第64话：少年！我把雅典娜交托给你们
第65话：圣剑吼叫！修罗对天龙
第66话：呀 紫龙！星消失了
第67话：再见吧！是师傅是朋友
第68话：美的战士！阿布罗狄
第69话：魔宫毒玫瑰！死的花香
第70话：安息！瞬、最后的微笑
第71话：火时计消失！教皇的真正身份
第72话：星矢 前进！朋友的逝去
第73话：友情的结集！女神的根源
北欧仙宫篇
第74话：极北之敌！传说的神斗士
第75话：希露达！渐入魔道的女神
第76话：巨人特路！憎恶的小宇宙
第77话：巨星之泪！为希露达而死
第78话：咬牙切齿！北方之狼芬尼路
第79话：悲哀！狼爪光速拳之宿命
第80话：于冰原消失！悲伤的呼号
第81话：弗莉亚！因爱而来的死斗
第82话：舞动白鸟！冰里的灼热地狱
第83话：妖异之竖琴！诱导瞬受死之序曲
第84话：死的宣言！竖琴镇魂曲
第85话：悲哀的勇者！冰的憎恶
第86话：不死鸟！燃至深红的翅膀
第87话：魔紫水晶！圣斗士的坟场
第88话：炎之剑！可怕的野心
第89话：邪恶之祭物！精灵们之森林
第90话：回头的星矢！升龙之小宇宙
第91话：燃烧瞬！黑牙所隐藏之谜
第92话：漩涡！瞬的究极星云气流
第93话：巴特！宿命的双子星
第94话：兄弟情结！史特眠于国
第95话：高雅的勇者！苏醒之传说骑士
第96话：双龙对战！万分之一的取胜机会
第97话：海魔女！美妙的死亡曲调
第98话：奇迹出现！奥丁圣衣
第99话：雅典娜！永远高贵的祷告
海皇神殿篇
第100话：海皇波士顿出现！圣战再度展开
第101话：一定要将之粉碎！七海中之巨柱们
第102话：发出神秘的光辉！金色的青铜圣衣
第103话：危险！瞬！！可怕的魔兽之牙
第104话：屠魔兽！不灭之黄金锁
第105话：圣剑！栖宿在右腕的修罗之魂
第106话：梦无痕！再会却是死的约会
第107话：心之猎人！无情的隆奈狄斯
第108话：艾尔扎克！拥有冰的心之男
第109话：努力吧贵鬼！悲哀的决斗
第110话：听吧！雅典娜的美妙歌声
第111话：朋友！让我们死时也在一起吧
第112话：两个的灵魂！海皇复活之道
第113话：把海皇射倒吧！黄金的一矢
第114话：光辉的友情之星！永远之少年传说
冥王十二宫篇
01 新的圣战的开始
02 哭泣的三人
03 蠢蠢欲动的影子
04 半神的赎罪
05 短暂的再会
06 远古的斗士
07 黑斗篷的兽群
08 踌躇的时刻
09 自豪的终结
10 金色的冲突
11 震撼的圣域
12 女神的圣衣
13 决意的早晨
冥王冥界篇前章
第一话：强渡！阿格龙河
第二话：寂静的法庭
第三话：传说中的圣斗士奥路菲
第四话：奥路菲 悲哀的镇魂歌
第五话：哈迪斯！惊愕的附体
第六话：激斗！通往GIUDECCA之路
冥王冥界篇后章
第1话：神罚！最终日蚀
第2话：一辉！恸哭之拳
第3话：女神！以性命为赌注
第4话：绝望！叹息之墙
第5话：集结！黄金圣衣
第6话：永别了！黄金圣斗士
冥王极乐净土篇
第01话 通向极乐净土的死门
第02话 死亡与睡眠之神
第03话 黄金的援军
第04话 传说的神圣衣
第05话 来自于神话的觉醒
第06话 前往充满光明的世界
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冥王神话LC的OVA共出了两季，共26集~~~
全集在线观看：http://www.youku.com/playlist_show/id_3476020.html
目前为止，还没有第三季的消息~~~
互相都是有关联的，从前到后的顺序。
另外还有四部，不对，是五部剧场版。本回答被提问者采纳