手术治疗，手术治疗分为三种囊肿摘除术、囊肿引流术、胰切除术。
治疗原则：1.除紧急情况外，胰腺假性囊肿应在发病3个月后施行手术治疗。2.除位于胰腺尾部的假性囊肿可以连同脾脏一并切除外，一般不作囊肿切除术。3.除囊肿破裂、出血或病情危重，囊肿合并严重感染或脓肿形成需要做囊肿外引流外，一般胰腺假性囊肿应作内引流而不作外引流术。
麻醉要求：持续硬膜外麻醉或气管内插管全麻
囊肿摘除术：囊肿摘除术最佳但只适用于胰尾部较小的囊肿，进行胰切除术时则是病情较为严重时进行的，做手术对人体的危害大，恢复较慢，不排除复发的可能。
中医治疗，中医治疗又有中医治疗与中苗治疗，中药内服利于体内吸收，药效强劲持久，安全无副作用，具有排脓除毒、调理气息、调和五脏的功效。中苗治疗，例如苗岭胰肿汤由多味苗岭珍稀药材精细研制而成，采集天然苗药现采现用，药用价值亦远胜于普通药材，相较于其他内服药物，药效强劲持久，治疗胰腺囊肿更彻底，疗效神奇显著。
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