这个很有可能是你在编辑绘图的过程中忽略了外部引用文件中包含的块文件，基本上出现这样的问题都是块文件名冲突所导致，，至于是哪个步骤出了问题就不好判断了。
其实说白了就是CAD软件正常情况下在出现块冲突的时候是会提示或直接出现块替换的现象，那么在当时你就会发现问题，而如果你说的情况出现，则很难判断是软件当时未提示或是其它原因所导致，这点就只能你自己去尝试分析，一般最简单的办法就是把你源图上的所有图元COPY到外部参照文件中，看看是否出现块被替换的情况，是的话那就不用说了，只是你会比较郁闷罢了。
至于你说的图形丢失，正常情况下是由于块替换导致的看似丢失，其实是被不同元素替换、位移所导致。当然图形丢失不是完全不存在，CAD软件本身有时候会出错，不过这种情况不太多见，特别是在高版本CAD中更是少见了。
追问是不是添加了外部参照的CAD图，不能被修改另存？
追答这倒是不太可能的，你采用的外部参照文件本身是不是被加锁了？不然正常的插入外部文件不存在不能另存的情况，要么你的机器中了CAD病毒或许也会出现莫名其妙的类似的错误。