满清起源于关外，是少数民族，官制中带有少数民族政权的性质、形式和内容，在疯狂扩张定鼎中原的时候迅速汉化，基本沿袭了明代官制的形式和内容，但是又有所变通。
一、清初中央官制概况
满洲在关外时，
努尔哈赤设计的是一种近似贵族共和政治的体制，在
八旗制度基础上，设立八旗议政王大臣制度。
皇太极则宣布按照明会典行事，在保留五大臣与旗主议政的同时，于天聪三年（1629年）设置了文馆，其官员负责翻译汉文书籍，记载本朝史事。1631年，仿明制设吏、户、礼、兵、刑、工六部，每部以贝勒为首长，下有承政三人，满、蒙、汉各一名，再下有参政八员和满、汉启心郎若干人。1636年，变文馆为内三院，成为满洲独创的机构，各设大学士一人，内国史院负责记注诏令，编纂史书；内秘书院撰拟各国往来文书，并录各衙门奏疏；内弘文院为皇帝进讲经史，颁布制度等。这就削弱了议政诸王的权力。同年还设立了督察院，至此军政分开。
为保证漠南蒙古各部稳定，在适应蒙古族游牧生活特点的情况下，设置了中央机构蒙古衙门，专管漠南蒙古地区事务，后改名为理藩院。理藩院是清朝新设的一个中央行政机构，虽不成部，其体制却由六部大致相同，下有旗籍、王会、典署、柔远、理刑六个清吏司。理藩院的官僚设置与六部相同，但尚书、左右侍郎有满人或极个别的蒙古人任职，郎中、员外郎和主事则全是满人，只有笔帖式几名例由汉军担任。清朝的理藩院，是中央高级机关之一，但进行过调整和改革，把原来独立的监察机构，长稽查六部和其他衙署的六科给事中并入了都察院，为其下属。御史和给事中被合称为科道，改变了自唐、宋以来检察机关台、谏分职的情况。但御史怕得罪权贵，往往不敢放言高论。（台谏是指御史台和谏议院。御史台“掌纠察官邪肃正纲纪”；谏议院“掌规谏讽谕，凡朝政阙失、大臣至非其人、三省及百官任百司事有违失皆得谏正。）
顺治十五年（1658年），裁内三院中的秘书、弘文、国史，设置殿阁大学士，置于六部之上成为内阁，行使中央政府职权。不过，清初的大学士以满洲大学士品级较高，政令虽出自内阁，但实权还在满洲贵族手中。
康熙时，内阁曾改为内三院，不久又恢复。内阁大学士就象古代的宰相，帮助皇帝处理机务，奉旨编撰诏书，表率百官。满汉各2人，协办大学士满汉各1人。康熙时在皇宫里设立南书房，把特颁诏旨的撰拟权改由南书房翰林担任，以改变内阁批答奏折，军国机要为议政处垄断的局面。挑选才品兼优的词臣入值，称南书房行走，组成皇帝处理政务的机要秘书班子。
雍正八年（1730年），因西北用兵而特设军机房，后称军机处，在隆宗门，选大学士及尚书侍郎为军机大臣，章京满汉各16 人，一切军国要务全掌握在君主手中。内阁失去实权，而专管诗文书画等事了。此后，一般政务仍有内阁经办，军国大政则有军机大臣面奉皇帝训示，拟旨颁发，这样议政王大臣会议和内阁就形同虚设了。大学士品级尊贵，但是有名无实。乾隆五十六年（1791年）议政王等虚名废除。
行政机关则是清朝的六部，1631年仿明制设立，不同之处是，清朝的户部为十四司，刑部为十八司，六部中增添了七品小京官若干人，又在正规官下设有笔帖式。六部首长尚书、侍郎中，有人在军机处供职，其余长官也定期朝见皇帝，汇报本部事务。六部之中，户部是唯一的财政总机关，权事最重。吏部只限于稽考中级一下官员的资历，根据例案予以准驳。兵部不过问军政峻岭，向受冷落。刑部是专业性机构，不熟悉律令就无法胜任，所以长官之中必有一人是本部司馆出身，主持本部的事务。工部因在外
河工不由本部经手，只是在宫廷典礼时才有办事的机会，很是清闲。礼部更不起眼，几乎无事可做。笔帖式官是清朝中央各机构所特有，其名微但人数最多，官品不过六七品，低则八九品，全有满人充任，在官府供职，有委署主事、掌稿、缮折、牌子等名称，专管笔札、收发。笔帖式升官很快，满人一旦任之，不几年就可升任员外郎或主事官，掌握官印。
除理藩院外，清朝另一新创的中央机构是内务府，设立于入关前，有总管内务府大臣主持工作，专管爱新觉罗皇室一家的日常生活事务。顺治帝死后，
清政府鉴于历代宦官参政导致祸乱的历史教训，下令关闭明朝的太监衙门将其并入内务府。康熙之后，内务府的组织机构进一步健全，下设有七司三院，总管内务府大臣是流官，要按期更换，堂司各级品级不过四品，有自成系统，不与各部、院、寺、监各官相统摄，使宫中、府中分而为二，从而一扫
秦汉以来太监窃权之弊政。清朝还新设了八旗都统衙门，包括八旗、蒙古八旗和汉军八旗，每旗设都统一人，副都统两人，分管本旗军民事务。其他如詹事府（原东宫太子的官员）、翰林院（储备人才顾问）、鸿胪寺、广禄寺、太常寺、太仆寺、
国子监（主管教育）等，均沿袭明制而设，终清未改。
主管审判的机构是
大理寺，和刑部、都察院合称三司。清初中央官制如下表：
中央官制
帝室部 佐理部 中枢部
院 寺 府 监 司 院 三法司 六部
二、清初地方官制概况
清初的行政区划较繁杂，主要有行省、道、府、其下有州、县、厅，还有特别行政区，东北和新疆、蒙古及土司等。
清入关后，把明的督、抚制巩固下来。清初，督、抚所辖区域并不明确，中期以后，才定为八督十二抚，各有所辖。督、抚职权也随时代而异，前期总督权力远比巡抚大，但后来日渐削弱，但后期有的巡抚也竟然不听总督的指挥了。纵观有清一代，督、抚各自辖区较为稳定，巡抚所辖为一省，总督最多为两省，少数为一省或三省。总督官称之外另加兵部尚书、右都御史官衔，巡抚加兵部侍郎、右副都御史衔，以便行使纠察权，让所有的官吏听其命令。总督主要管军事，统辖文武军民，为一方保障。巡抚统治一省，各有定员，分寄以守土之责。督、抚是实官，地方上的封疆大吏。清时设布政史、按察史二司，名义上与省级平行。二司首长实际上将为督、抚的僚属。乾隆后，清道员成为地方上的实官，定为正四品。此外，还设有一些不按地域划分的专职道员，如粮道、驿传道、盐法道、海关道等。和历代一样，清朝的州县是省的基层，府是州县的商机。府的佐官有同知、通判、推官等，后来裁去推官，一些同知和通判也被派往府境内分防，久而久之就形成了府的一个行政单位厅，也有的厅设在边区少数民族聚居的地区。厅又分直隶厅和散厅，直隶厅很少辖有属县，大的直隶厅相当于府，直隶于省，而散厅相当于州县。基层州县的州，也分直隶州和散州两种。直隶州相当于府，散州与县相当。全国总计有七十六个直隶州和四十八个散州。县设知县一人，佐官有县丞、典史各一人，主薄无定员，清末全国共计1358个县。在县内的重要乡，派巡检驻守。县下有保甲编制，但非正式的行政系统，用以维护地方治安。清朝的府、州、县组织不健全，都没有属员，地方长官也没有任命属员的权力，执行公务的全靠吏役。由于官府缺乏办公费用，官员俸禄有很低，至于吏役几乎没有工资，就公开贪污营私，造成吏治的腐败。
清朝在边区的行政和官僚设置相当复杂，也不一致，总的说是因地制宜，实行特殊设置，即用军政长官制度来代替内地的行省制度。
东北三省是清的发祥地，行政上实行双轨制。
康熙年间，分设奉天将军、吉林将军和黑龙江将军，以及副都统、城守尉等武官管理八旗人丁和少数民族，另设奉天府和各州县管辖汉人。在原都盛京设户、礼、兵、刑、工五部及内务府，五部各设侍郎一人，都是满人，以示与京师顺天府有别。内务府总管大臣由奉天将军坚韧，其权力显然在其他两将军之上。清朝对西藏的统治仍沿袭元朝以来的政教合一的制度，设驻藏大臣一人驻拉萨，帮办大臣一人驻
日喀则，管理全藏的军民正武。下设四个葛布伦组成西藏地方政府，任用各级藏官进行统治。在新疆
维吾尔族聚居地区推行军民分治，设伊犁将军一人，总关天山南北地区的军政，各城市分置官员统领，名称不一，但军队编制略与内地各省
绿营编制相同。民治则在维吾尔族原有组织的基础上推行伯克制，南疆三十一城各设伯克，但名号不同，用于统治民众。清朝对内、
外蒙古和青海地区少数民族各部落实行随俗而治，推行旗盟制度。其设旗长，又理藩院挑选旗内最有威望的王宫贵旗担任，管理一旗的军民，合数旗为一盟，设盟长正、副各一人主持盟务。又在内蒙古设绥远将军一人；外蒙古设乌里雅苏台将军一人。另在青海设办事大臣一人，分别统领各自的旗盟，而隶属于理藩院。清朝为了打通西南腹地少数民族区域的交通线，削弱格土司的割据势力，沿袭明制，在西南大部分地区实行“改土归流”，废除土司制度，又清廷委派流官直接进行统治，把府、州、县的官制改为与内地相同，从而加强了中央对西南各族人民的统治。
三、晚清中央官制流变
鸦片战争后，清朝又增设了一些新的机构。如为了管理通商事务，设立五口通商大臣，随着通商口岸的增多又设立南洋、北洋大臣等，但不是大规模重要的改革。重要改革如下：
咸丰十一年（1861年），为适应繁重的外交事务，设立
总理各国事务衙门，简称总理衙门，又称“总署”或“译署”，仿军机处的体系，设有大臣和章京良机。总理大臣由皇帝特简，总理大臣上行走则在内阁和部院堂官内选任。掌京一级官员分为四种，即总办章京、帮办章京、掌京、额外章京，负责办理具体事务，草拟奏章，纵理文书等。下设英国、法国、俄国、美国、海防五股，负责对外交涉及各项“洋务”。1901年，清政府受列强的压力，被迫将总理衙门改为外务部，班列六部之首。外务部由总理、会办、左右侍郎组成，并将原总理衙门的总办章京改为左右丞、左右参议，下设司务厅，以及徽、考工、榷算、庶务四司，俄国、德国、法国、英国、日本、电报六处和清档房，分管各项具体事务。同时还有一些事务分列出去，由其他部门管理，或由督抚接替。相当我们后来的外交部。
光绪三十一年（1905年），清政府派大臣出洋考察宪政，设立考察政治馆。后年，该称宪政编查馆。有军机处大臣督饬，设提调二员总理馆中事务。其职掌事：议复奉旨交议有关宪政折件，及承拟军机大臣交付调查各件；调查各国宪法，编定宪法草案；考核法律馆所定法典草案，各部院、各省所订单行法及行政法规；调查各国统计，变成各国统计表及各国比较统计表。1911年，清廷颁布内阁属官官制，宪政编查馆被裁撤。
资政院于1907年设立，议员有钦选和民选两种，并规定了一定的章程。1906年预备立宪，准备把内阁军机处改并为责任内阁，新内阁下辖十部：外务部、民政部、度支部、学部、陆军部、海军部、法部、农工商部、邮传部、理藩部。
四、晚清地方官制流变
鸦片战争以后，清政府在地方新增设立一些机构和职官。1906年，清裁撤各省学政，该设提学使司提学使，秩正三品，统辖全省地方学务，归督抚节制。提学使执掌教育行政，稽核学校规程，考核各属教师、教职。各驻防学堂，亦概归管辖。提学使衙门的内部组织机构由总务、专门、普通、实业、图书、会计六科。设科长、科员。提学使署官还有“省视学”六人，承提学使之命，巡视各府、厅、州、县之学务。
1907年，将各省原设提刑按察使改设提法使，受本管总督、巡抚节制，管理各省司法行政事务，监督各审判厅，并调度监察事务。提法使司内部设总务、刑民、典狱三科。每科设科长一元，秩视五品，禀承提法使之命，协同科长，分理本科事务。各科配设书记五人，秩视八、九品，受科长、科员的指挥，缮写文件、办理庶务。同年，总核官制大臣遵旨拟定改革外省官制通则，提出与各省增设巡警道，专管全省巡警、消防、户籍、营缮、卫生诸事务，置司到一人领其事。
1908年民政部奏报所拟定的巡警道官制。按新官制，各省巡警道官，秩正四品，归本省之总督、巡抚统辖，管理全省巡警事务。巡警道规定任期三年，接受督抚的考核，并受民政部之随时考察。
在1907年，清政府设劝业道。劝业道各省设一人，秩品正四品，归本省总督、巡抚统属。劝业道掌全省之农工、商业、交通、矿务、邮传等各项实业之管理。劝业道任期三年，任内受总督、巡抚考核，并由农工商业部，邮传部随时考察。
地方上随着清末新政开展而设立了资政局。不过清末改革有集权于满洲贵族的不良目的和想法。