文献管理的专业软件如下：
一、 Endnote。
EndNote 是 SCI（Thomson Scientific 公司）的官方软件。
支持国际期刊的参考文献格式有 3776 种，写作模板几百种，涵盖各个领域的杂志，功能十分强大！
Endnote 面世比较早，加上其优秀的文献管理功能，所以 Endnote 可以说是市场上使用人数最多，占比最高的文献管理软件。
优点：
（1） endnote 作为一款受众面最广的软件，其支持的文献数据自然有很多，基本上世界上的大多数数据库 endnote 都可以直接访问。
（2） endnote 可以将自己的文献导出，支持 RTF、HTML、XML、TXT 四种导出格式，可以通过这种方式与他人共享文献。
（3）endnote 内置了多种引文模板，几乎覆盖了世界上所有的 sci 的引文格式，并且在修改文章内容时还可以自动更新。
缺点：
（1）对 WPS 支持度不高，对一句话引用多篇文献可能会报错，因此习惯使用 WPS 的同学慎用 Endnote。
（2）不支持标签管理，仅支持 group 管理，并且只能创建 group 和子 group。
当文献较多时，这个弊端就会显现出来，想在文献库中找文献比较麻烦。
（3）新版的 Endnote20 不支持 PDF 预览了，并且 Endnote 自带的 PDF 阅读器不是很好用，容易卡顿。
二、 Zotero。
Zotero 作为一款开源的软件，和 Endnote 比最大的优势就是免费！
再加上其本身的扩展性强，所以笔者认为 Zotero 的好用程度要超过 Endnote。
Zotero 相对于其他的文献管理软件相比更像是一个知识管理软件，它不仅仅只限于对文献的管理，还可以实现对知识的整合。
优点：
（1）免费！免费！免费 ! 重要的事情说三遍，对于一个穷研究僧来说，光免费一个优点就可以盖过大部分缺点了。
（2）开源，插件众多，很多功能都可以通过装插件来实现，甚至动手能力强的小伙伴还可以自己设计插件。
（3）抓取能力强，Zotero 不仅能在知网、pubmed 上抓取文献，还能在知乎、百度甚至是 B 站上抓取数据。
（4）Zotero 支持 RSS 订阅追踪期刊的最新文章。
缺点：
（1）基础功能不足：插件是 Zotero 的精髓所在，Zotero 不装插件的情况下其功能是很少的，对于不爱折腾的同学来说 Zotero 可能并不是一个特别理想的选择。
（2） 没有装插件的话，对中文文献不是很友好。
（3）不能管理太多的文献，如果管理的文献比较多的话，Zotero 就会比较拉顿。