1、时间期限不同：宅基地使用者没有期限限制，土地使用证有30年50年70年的期限限制，划拨土地使用证也没有期限限制。
2、用途不同：厂房、村办企业的建的的房屋的地下的土地不能叫宅基地使用证，可以叫集体土地建设用地使用证;而宅基地使用证泛指集体组织成员的人(也就是本村农户的人)建的住宅房屋地下的土地。
3、耕地在国土资源局的规划档案里面是有记录的。耕种土地不可以随便变更用途，宅基地倒是可以转成耕地。
扩展资料：
一、申请
申请人持申请材料向当地村委会提出书面用地申请。村委会应当在每一个季度集中申请材料，依法召开村委会或村民代表大会进行审议，并张榜公布，在张榜公布之日起15个工作日内本村村民未提出异议或者异议不成立的，上报给乡镇国土资源所初审。
二、现场勘查
乡(镇)人民政府组织国土资源所进行现场勘查和群众调查，审查建房用地和建设申请条件，并制作勘查笔录和审查意见书。
三、填申请表
国土资源所初审合格后发放《农村村民住宅用地与建设申请表》。
四、村委会审查
村委会对申请人提交的《农村村民住宅用地与建设申请表》进行审查并签署意见，证明申请人的原住宅用地情况和家庭成员现居住情况，由负责人签字，同时加盖村民委员会公章，报乡(镇)人民政府审核。
五、审核上报
乡(镇)人民政府在收到村委会上报的住宅建设用地申请材料后完成审核并现场确定规划用地范围，并报县国土资源局初审。县国土资源局对符合审批条件的上报县人民政府。
六、审批
县人民政府批准用地的，由县国土资源局颁发《建设用地批准书》。
七、放样
由国土资源所牵头协同乡镇政府人员根据《建设用地批准书》和《村镇建设工程规划许可证》到实地放样，划定范围，填写《放样记录卡》，放样参加人应当在《放样记录卡》上签字。放样后，用地申请人方能动工建设。
八、验收发证
新建、改建、扩建农村村民住宅，应当自房屋竣工验收合格之日起30个工作日内依法申请办理土地初始登记或者变更登记手续和房屋产权登记手续，领取土地使用权证书和房屋所有权证书。
参考资料：百度百科—农村宅基地
2、农村宅基地是指农村用于生活居住的宅基地；耕地是指种植农作物的土地，包括熟地，新开发、复垦、整理地，休闲地（含轮歇地、休耕地）；以种植农作物（含蔬菜）为主，间有零星果树、桑树或其他树木的土地；平均每年能保证收获一季的已垦滩地和海涂。耕地中包括南方宽度〈1.0米，北方宽度〈2.0米固定的沟、渠、路和地坎（埂）；临时种植药材、草皮、花卉、苗木等的耕地，临时种植果树、茶树和林木且耕作层未破坏的耕地，以及其他临时改变用途的耕地。
《土地管理法》第十九条规定，县级土地利用总体规划应当划分土地利用区，明确土地用途。
乡（镇）土地利用总体规划应当划分土地利用区，根据土地使用条件，确定每一块土地的用途，并予以公告。
也就是说，一块土地到底是属于宅基地还是耕地，由国家来定。
根据《土地管理法》的规定，我国土地按用途分为农用地、建设用地和未利用地。耕地是农用地的一种，而宅基地是建设用地的一种。
还可以把宅基地的定义扩大，就是自己房子周边，不属于种植用的耕地、种树用的林地等这类分开的都可以看作是宅基地。
宅基地有时也可以称为建设用地，顾名思义是用来建设的，建房、建路、建水沟的这些都可以称为建设用地。本回答被网友采纳