利用种子繁殖苗木的方法。果树生产上多用以繁殖砧木苗，也可以繁殖果苗，这种苗木称实生苗。实生繁殖是原始的繁殖方法，具有种子来源丰富，方法简便，成本较低，适于大量育苗等特点，至今仍是一种重要的繁殖方法。
实生苗的特点
①实生苗主根强大、根系发达、入土较深，对环境条件的适应能力、抗逆力均较强，寿命长，但管理不便。②实生苗的阶段发育（见阶段发育）是从种胚开始的，有童期（见个体发育），进入结果期较迟，具有很大的变异性及相应的适应性。③绝大多数果树是异花授粉植物，种子的遗传因子复杂，实生后代有明显的分离现象，母本植株的优良经济性状，不容易在后代个体间保持相对的一致性。④少数果树具有无融合生殖特性（见无融合生殖），如柑橘、杧果、苹果属中的湖北海棠、锡金海棠等树种中有无融合生殖类型，其后代极少分离，苗木整齐一致。
实生苗的利用
①经过长期的栽培实践，人们认识到实生繁殖不能保持果树的优质、丰产特性，多数果树已采用分株、压条、扦插、嫁接等方法进行繁殖，目前只有象榛子、阿月浑子、罗汉果、杧果、腰果、番木瓜、椰子、银杏等少数实生繁殖变异性较小，或无性繁殖比较困难的种类和品种还沿用实生繁殖。②大多数果树利用近缘野生植物或半栽培种的实生苗为根砧（见基砧），以增强树体的抗逆性和适应性。③果树的杂交育种工作中获得的杂种实生苗，经选择、鉴定，是培育新品种的基础材料。④柑橘类果树利用珠心胚或其他无融合生殖类型种子播种，获得不带有病毒的生长一致的实生果苗。
实生苗的培育
选择品种纯正、生长健壮、无严重病虫为害的植株为采种母树，在果实成熟时采集种子，并迅速洗净除去杂质。常绿果树种子可立即播种；落叶果树种子要阴干后置通风处保存或湿藏于沙中层积。播种前根据不同树种种子的特性进行种子处理（见种子处理）然后播种培育成苗。
实生苗
见实生繁殖。
实生选种
在自然授粉产生的种子播种后形成的实生植株群体中，采用混合选择或单株选择得到新品种的方法。选择的方法有两种，其一是通过逐代的混合选择，按照一定的目标来改进果树群体的遗传组成，形成以实生繁殖为主的群体品种；其二是从实生树群体中选择优株，通过嫁接繁殖以形成营养系品种。
实生选种具有悠久的历史，早在3000年前，人们就对野生或半野生的果树进行选择。经过许多世代的逐步选择和提高，从野生类型向人类需要的栽培类型演化，这种方法在品种进化中起着重要作用。在选种的早期阶段，就是对实生繁殖的果树进行混合选择，同时将选择的种子，进行混合繁殖，向一定目标培养，不断提高品种水平。例如陕西扶风的隔年核桃就是按早实性，经多世代选择，最后形成播种后经2、3年就能开花结果的品种类型。山西汾阳在实生繁殖核桃时，选用个大、皮薄、仁满的坚果来混合播种，以改进实生繁殖群体的水平，原先野生核桃核壳坚厚、内褶壁发达而仁小。通过选种，形成现在的纸皮核桃、蛋壳核桃等壳薄而仁满的类型。某些地区生产上采用实生繁殖的果树，特别以坚果类果树为主，如核桃、板栗、银杏、香榧、榛子等多数采用这种方法。柑橘类中一些多胚性的宽皮橘品种，也曾采用实生选种。随着栽培水平的提高，果树的繁殖方法从实生繁殖逐步过渡到营养繁殖。特别是生产中主要采用嫁接繁殖以后，实生选种就着重于优良单株的选择，而后经嫁接繁殖形成营养系品种。著名的温州蜜柑最初就是从播种柑橘种子长成的实生苗中选出的无核单株，以后经嫁接繁殖形成的品种，现今已成为柑橘栽培北缘地带分布最广的主栽品种。罐藏黄桃新品种丰黄、连黄等，也是从早生黄金种子播种后的实生树中选出的单株，经嫁接繁殖而成为当前广泛栽培的罐桃品种。
对实生繁殖的果树，为提高群体某些性状的水平在人为的选择影响下，对群体中具有某些性状的植株进行逐年选择，这样能打破群体原有的遗传平衡，在较短的时间内也能改变群体的基因频率和基因型频率。在各世代中改变的速度和程度，决定于选择强度，当选择强度大时，改变的速度快和程度高。选择的效果就是子代和亲代间性状的平均值之差，用选择响应（R）来表示。选择响应等于该性状的选择差（S）和狭义遗传力（h2）的乘积，即R＝Sh2。为了提高选择效果，应在性状变异幅度大的群体中进行高强度的选择。
为了提高果树产品的商品性，要求品种的纯度高，现今已摒弃不能保持品种典型性的实生繁殖，而采用嫁接等营养繁殖的方法。果树的实生选种主要用于对现有实生树的单株选择，或播种自然授粉种子形成的实生树群体中进行单株选择；然后通过营养繁殖形成营养系品种，用于生产。在利用播种自然授粉种子进行选种时，必须选择具有多数优良性状的品种和母树，也要注意授粉环境，避免野生类型或不良品种参与授粉而影响其后代的选种效果。对于某些能自交结实的树种（如桃、葡萄等），如果控制某些性状的基因型是纯合的，在自交后代可以保持这种性状而不致产生分离，如播种黄肉、不溶质、粘核的专用罐桃品种，在不受外来花粉影响下，自交后代都会表现具有这3种目的性状的实生树。
进行实生选种，应首先确定选种的目标和选种的标准，这是衡量优系能否入选的依据。选种目标要根据需要确定，切合实际，应侧重某一个或几个方面，比如在某些病虫害发生严重的地区，要注意选择具有抗病虫性的植株；在中国北部寒冷地区则应侧重选择具有抗寒性的植株。在选种目标中，高产、优质是共同的要求。至于选择标准，在不同的选种阶段应有所不同。在发动群众的初选阶段，选种标准应该简单而明确，以便有较多的单株入选。在组织专业人员开展初选时，则应提出比较具体的选种标准，以确定重点入选单株。实生选种一般来说按初选、复选和决选的选种程序进行。初选一般是结合群众报种，到实地果园中去考察，目测预选，对符合要求的植株进行标记编号，作为初选的预选树，然后专业人员对预选树进行现场调查记载，采集果实样品进行室内分析，并对记录材料进行整理和分析对比，确定初选单株。复选阶段主要是对初选树再次进行评选，通过繁殖成营养系在选种园里进行比较，也可结合进行生态试验和生产试验，复选出优良单株，然后由国家品种委员会组织品种比较试验和适应性试验进行决选最后确定新品种的价值，定名推广。