首先你说的咖啡应该是速溶的，糖分过高的危害就不说了，植脂末/奶精/伴侣/氢化植物油不利于身体排出，长期对心血管等可能有影响。不过这两年食品中的反式脂肪酸降低至几近于0了，估计对身体影响也不会太大。实在条件不允许，题主和两年速溶也不打紧。
因此我建议你多花点钱买“挂耳咖啡”（大约5-10元一杯）或者买个100+元的法压壶（不连电）/美式咖啡机（联电），这些都是比较方便的咖啡喝法。用真正的咖啡粉萃取真正的咖啡喝，可以适量加糖加牛奶，和喝一杯甜豆浆有什么区别呢？
其次是降低咖啡本身的“危害”，我的药理老师说过所谓“坏处”是“药理作用”的延伸，我个人认为纯咖啡本质也就是咖啡豆浆，和红茶等茶饮没有什么区别。
咖啡能使人明显感受到的作用：
1.咖啡能利小便、促进胃酸分泌、肠胃蠕动，也就是可以促消化，但是空腹/量多/长期可能会导致消化道溃疡（但也由于促进胆囊收缩降低了胆石症的发生）。
2.咖啡可以兴奋中枢，提高注意力、自信心、工作效率，但是高摄入会导致焦虑烦躁不安失眠等。
3.咖啡会使心率加快、血压升高，可能会导致心律失常，也就是心悸。
减少坏处的方法：
可以选择餐后饮用，或者先吃点小点心垫垫肚子避免空腹。
一天一杯就足够了，摄入的越多不良反应发生的可能性越大
咖啡因的半衰期为3-4个小时（也就是在人体中代谢到只剩一半的时间），因人而异，可能会更长，你可以自我感觉咖啡对自己的效果调节摄入量和每天最后的饮用时间。比如说每天10点后不喝咖啡，每天最多喝1.5杯。
我觉得题主才高中，身体正是健壮的时候。咖啡会导致骨质疏松等说法还没有定论，何况喝点牛奶还能补钙呢，放轻松，喝杯咖啡而已
先问是不是，再说为什么。
喝咖啡对人没有任何坏处，反而有好处。不喝咖啡的人才更有可能患更多的疾病。
所以你根本不用担心，该喝就喝。特别是早晨饭后一杯咖啡，一定会让你学习效率很高。
剂量问题才是问题。一天喝几杯咖啡没有问题，关键是要注意：不要一次喝太多咖啡。
特别是在星巴克咖啡这样的地方，不要贪优惠，千万不要点“大杯”和“超大杯”，就要中杯即可。无论你喝什么咖啡都这样，不要升杯。
补充：有些独立咖啡店（类似精品咖啡店）可能给的咖啡更多，比星巴克还要多。四份，六份意式浓缩咖啡放在一个杯子里，一时死不了，时间长了，难说！
英国曾经报道，有一个女孩连续喝了13杯意式浓缩，当时就晕过去了。送到医院抢救才好了。
九十年代流行滋补火锅，我一个同事（20出头的女孩）晚饭吃完，回家就流鼻血。那个时代的滋补火锅真的实在“大补”。
切记！
我不太清楚是不是国内人有咖啡因敏感体质，很多人会说喝了咖啡身上起红点。在长期喝咖啡之前，我建议你这样做：
1尝试两天或三天喝一次，时间在中午之前。看一下自己是不是有什么特别的反应：头晕，兴奋过度，肠胃不消化，发热，身上有过敏反应。如果出现上述咖啡因现象，一般喝两杯水排泄掉就行了。
2如果真的开始规律性喝咖啡，注意不能太晚。咖啡因代谢周期是四小时左右，太晚会影响睡眠。咖啡不是你用来熬夜的工具。
3即使你连续喝好几杯咖啡，也并没有加倍的提神效果，只有副作用。
4有的人喝完奶咖之后，会胃不舒服（包括速溶的调和奶咖）。这有可能是牛奶的乳糖不耐受，可能与咖啡无关。此时你可以试一下黑咖啡，就可以判断了。
5如果喝黑咖啡，美式or意式浓缩，注意要吃一点淀粉类食物，空腹不行的。
最后，咖啡就是个提神饮料，跟茶类似。不用特别在乎，喜欢就喝，不喜欢就拜拜。
Enjoy