鲁迅和秋瑾在日本留学时关系很好，但秋瑾还是因为他的政治地位而对鲁迅动刀，这就是后来发生的事，毕业后，他们去了不同的地方。
鲁迅也出生在官僚主义家庭，但他年轻的时候，家庭发生了变化，甚至家庭垮台，父亲也在那时去世。虽然在绍兴，它可以被视为一个面对面的家庭，但生活变得越来越困难，只是徒劳，同时，年轻的鲁迅不能走官路参加科考，也不能进某个官僚的门当助手，于是他走了第三条路，那就是去“外国学校”学习。
这所新学校当时没有被中国人接受，很多人认为上这所学校的学生“把灵魂卖给了洋鬼子”，所以他们非常鄙视这类学生，鲁迅要上南京海军学校，学费是8元，在这一点上，鲁迅的母亲在聚在一起之前，不得不筹钱很久，鲁迅在南京读书时读了很多外国作品，打开视野的鲁迅，看到了这个腐朽破碎的国家，试图思考它的未来和出路，为了寻求救国的真理，鲁迅凭借其卓越的成就，获得了公费留学日本的机会。
秋瑾的性格在当时似乎是独一无二的，她写诗，写诗，喝酒，练武术，骑马和弓箭，他甚至出现在公共场合，并去剧院，在当时的人们眼里，他们都是离经叛道的，被人嘲笑的，然而，她并没有认真对待，并给自己取了简虎女夏的名字。萧晓经常与城里的才华横溢的人聚在一起，喝酒、弹钢琴迎战月亮，它有一个名人的风格，不怕过路人的讥笑。然而，由于秋瑾的家世广为人知，向她求婚的富豪官员络绎不绝。最后，她父亲决定选湖南富家子弟王廷军。
鲁迅生前说过，他不会原谅他们中的任何一个，然而，鲁迅从未说过秋瑾的坏话。弃医后，鲁迅在几篇文章中赞扬了她的革命。由此可见，鲁迅虽然不同意秋瑾的主张，但他尊重革命家秋瑾。
“秋瑾刀斩鲁迅”的公案，从头到尾是“历史发明家”移花接木的结果，并非事实。但鲁迅与秋瑾在日本期间，的确曾有过一定程度的冲突，也正是基于此，才有了后面“秋瑾刀砍鲁迅”谣言的盛行。
鲁迅去日本留学是官费生，而比鲁迅大了6岁的秋瑾则是自费去日本留学。1905年，面对日益蜂拥而至的中国自费留学生，日本很有些吃不消。
这一来是因为人数实在太过庞大，自日本允许清国留学生赴日后，日本的中国自费留学生在短短三年时间里迅速增长了16倍，由最初的600人暴增到8000多人；二来是因为相比经过筛选的公费生，自费生的素质相对较低，这严重影响了日本的正常教学秩序。
于是，日本在这种社会背景下迅速出台了相应的政策措施，这就是1905年11月2日，日本政府正式颁布的《关于准许清国学生入学只公私立学校之规程》。
这个规程是用日文发布的，接下来发生的一切再次证明了日本发布这个规程是相当必要的。因为，大部分自费生日语并不过关，于是自费生将日语中管理、规范一词翻译或者理解成了“取缔”。
紧接着，以秋瑾为首的激进派开始认为这是日本与清政府勾结的结果。当时的国内，清政府与逐渐兴起的早期革命派已经开始出现对立。
不久后，坚决反对清政府的留学生陈天华，为反对规程而在东京大森海湾愤而蹈海自杀，时年30岁。
随后，秋瑾等在陈天华的追悼会上发起了为反对“取缔”集体回国的集会。而鲁迅等则认为，这个规程很有必要，它和清政府也完全无关，并不存在所谓日本与清政府勾结。因而，留学生完全没有必要为此表现得情绪如此激动并嚷嚷着集体回国。
在追悼会上，作为召集人的秋瑾还在会上掏出日本刀插在讲台上说：‘如有人回到祖国，投降满虏，卖友求荣，欺压汉人，吃我一刀。
从此处看，秋瑾虽然与鲁迅确实存在观点不一的情况，但秋瑾的“一刀”却并非针对鲁迅或者具体的任何人。可“历史发明家”却掐头去尾地把“如有人回到祖国”这个前提去掉了，这样一来，这段话便可以直指鲁迅等不愿意回国的留学生了。
实际上，秋瑾虽然鼓励留学生回国，但并未强制要求所有留学生照做，自然也并不会觉得所有不回国者都是“投降满虏”必须“吃她一刀”的人了。
综上：鲁迅与秋瑾并无真正的直接冲突，“给鲁迅一刀”更是谣言一桩了。
本回答被网友采纳主要也是因为两人的政治立场不同。
众所周知，鲁迅出生在官僚家庭里面，在幼年时期，因为家庭变故，所以他们家族势力早就不如从前那样兴旺了。在他父亲去世之后，他就参加了高考，想要做上一官半职，后来他又去了洋学堂念书。在一开始这样的洋学堂受到很多成见，为了救自己，为了救国家，他后来通过考试，远赴日本留学。
而秋瑾呢，站在古时女性的性格角度上来看，她无疑是最独特的那个，她喜欢诗词，更喜欢射箭。在古时候女性不能抛头露面的环境下，她总是外出看戏，在许多人的眼中，她的这些行为实属叛逆，而且更让人耻笑。她的家世显赫，最后其父母给她挑选了一个富豪，虽然对方也有着显赫的家世，但文采方面根本比不上秋瑾。秋瑾在嫁人了，因为有娘家撑腰，所以她的生活质量还是非常高的。
到后来她跟丈夫再也无法有共同语言，随后她就去了国外留学，一直到后来鲁迅参加了暗杀组织，再后来被分配了任务的时候，他又临时起了退意，因为他担心家中母亲无人照顾。在知道这件事情后，秋瑾便和鲁迅彻底断绝了关系，再加上后来出现的一些政治事件，他们俩人在意见方面有很大的不同，所以最终才拔刀相向。
但还有人说秋瑾的这一刀，并非指鲁迅或者具体某人，而是指的这些不愿归国的留学生。
虽然鲁迅和秋瑾的关系一开始极好，两人是绍兴的老乡，但是鲁迅不是秋瑾心目中的那种爱国青年，甚至对鲁迅的一些做法都是嗤之以鼻的，最后更是起了矛盾，秋瑾直接对鲁迅拔刀相向。
当秋瑾来到日本之后，经过同乡会，成为了坚定的爱国主义分子。
而鲁迅等人也都是浙江学会的骨干分子，再加上鲁迅曾经多次的集会或者其他的地方发表了慷慨激扬的演讲，激发了很多人的爱国热情。这时的秋瑾对鲁迅的印象是极好的。
后来日俄战争即将打响，导致了国内的形势非常的严峻。鲁迅所在的学会认为不光是要宣传知识，还应该有武装起义，为此成立了暗杀组织。
而鲁迅后来加入了其中，并且被分配了任务，在任务行动前，鲁迅就说道：“暗杀任务是可以去做，但是假如自己没了，自己的母亲怎么办。”这话就让其他人认为鲁迅退缩了，而秋瑾也知道了这件事，就对他有一些看不起，交往从此也少了很多。
后来清政府为了打击这些留学生，就联合日本政府出台了《清国留学生取缔规则》，并且引起了轩然大波。秋瑾这时就四处演讲，宣传让留学生回国。
而鲁迅却认为不能这样做，因为新规则还没有确认，同时认为自己的学业还没有完成，回去了也是一事无成，于是主张继续留在日本学习。
从此日本留学生就存在两个分歧，并且日本媒体乘机发表言论嘲笑留学生。陈天华为了表达自己内心的悲愤跳海自杀。在他的追悼会上，秋瑾为首的人就将鲁迅等不愿回国的人判处“死刑”。并且从靴子里面拿出刀，对准鲁迅。