汉武帝时期，官律非常严格。再加上汉武帝生性残忍，所以经常用重刑来惩罚犯错的人。酷刑会导致许多不公正的监禁，即使是像司马迁这样的清官。
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司马迁被判宫刑，用今天的话说太老实了。当时李陵被单于围困，弹药和粮食都用光了。无奈之下，他只好投降匈奴，成为战俘。汉武帝对此非常生气，手下的高官也来不及继续夸奖李陵了。相反，他们说他们不以李玲为耻。汉武帝向司马迁求教。但司马迁坦言，李陵一直是一个勤政、善良、忠诚、爱国的精兵。如果他说投降了，怎么会投降呢？也许他还在想着什么时候能重返宫廷，重新效忠国家。司马迁的话违背了汉武帝的意思，汉武帝就把司马迁关进了铁牢。
后来汉武帝派公孙瓒去匈奴见李陵。公孙敖失败了，他担心汉武帝会怪罪他，于是公孙敖诬告李陵在匈奴练兵时奉单于之命攻打长安。汉武帝信以为真，一气之下下令杀了李陵的妻儿。代表李陵的司马迁也受到牵连，被依法处决。但是，汉朝可以用阉割代替死刑。司马迁心中还有远大的理想，背上还有爷爷奶奶的遗愿，于是司马迁选择了被阉割，保住了性命。
后人能看到经典的《史记》也是司马迁的选择。司马迁忍受了常人难以想象的屈辱和痛苦。完成这项工作是中国人的一大幸事。
司马迁写史书的过程
司马迁早在公元前104年就写了《史记》，当时司马迁开始写《史记》，后来称为《史记》。
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司马迁早年游历全国，收集各地风土人情，了解当地人民的古老故事，然后向孔安国、董仲舒取经。司马迁有写作的能力和材料，所以很早就开始写作了。
但没有人的人生会一帆风顺，司马迁也是如此。公元前98年，发生了一起事故。当时李陵邀五千兵攻打匈奴，大败被俘。汉武帝对此非常生气。汉武帝问司马迁对这件事怎么看。司马迁说李陵孝顺父母，忠君爱国，投降是无奈之举。于是汉武帝派司马迁去罗天。之后，李陵向匈奴投降，孙敖“坐大”，司马迁受到牵连，被判宫刑。
司马迁大受羞辱，一蹶不振。他反而更加努力，把全部精力投入到《史记》的创作中。根据书籍《世界之书》，《国语》，《季芹》等。当时社会上流传的，以及各种学派著述所在国的文献档案，还有他自己在当地调查得到的一些材料，他对收集到的材料进行了精挑细选，排除了没有根据的谣言，对无法证实的事情持保留态度，或者附上各种说法。经过14年的努力，司马迁完成了这部历史著作《史记》，为后人留下了宝贵的文化财富。
后人对司马迁的评价
作为我国历史上著名的历史学家，司马迁一生致力于完成我国第一部纪传体史《史记》。完成这本书的过程并不顺利。司马迁先是为该书做了大量的准备，在写作过程中被判有罪，囚禁在宫中。可以说《史记》是他毕生的心血。后人对司马迁的评价是什么？
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汉代的杨雄写了一本书叫《法眼》，他在书中写道：“国家的历史被触动了，这叫记录。”“儿子爱多少，他就爱多少。”于是，杨雄成了第一个赞美司马迁真精神的人。他认为司马迁其实是在记录人物，他认为司马迁喜欢巫师的观点也是人们公认的。班固是系统评价司马迁的历史人物。在班固的《韩曙》中，班固特意写了一个《司马迁传》。文章说，“自刘向、杨写了一批书，都自称有好的史料运动。根据他们的情况，他们是有序的，合理的。他们争论过，但意见不一致。他们素质高，但不低俗。他们文笔耿直，内核不空，不藏恶。因此，它们被称为真实记录。”班固称赞司马迁“无美无恶”的纪实精神，给后人留下了深刻的印象。司马迁的纪实精神也成为中国史学的优良传统。
唐代学者韩愈称赞司马迁。在他看来，司马迁的文风是“雄浑、深邃、飘逸”。韩愈曾说“除了司马相如、太史公、刘向、杨雄，汉人不会写字”，可见他对司马迁的崇敬之情。宋元时期，马村和郑樵也相继对司马迁进行了赞美。其中，马村主要歌颂了司马迁的英雄之旅。他说司马迁“做了世界上所有伟大的事情来帮助我的精神，然后把它作为一本书吐出来。”所以司马迁的文笔，或豪放，或深沉含蓄。南宋历史学家郑樵说：“司马迁父子从事古籍整理工作，从黄帝到秦汉，一共写了五卷。所以，史家不能改方法，学者也不能改书本。六经之后，就只有这本书了。”可以看出，郑樵对司马迁的评价很高。
明清时期的金圣叹、钱、章学诚、赵翼、梁启超都对司马迁进行过评价。金圣叹可以说是司马迁的心腹，他的论述《史记》是独一无二的。赵翼称司马迁为“伟大的历史学家”。另一方面，梁启超认为“史学界毛泽东推司马迁”，并对《史记》予以高度评价，称“读书人必读”。
到了现代，鲁迅称《史记》是史家的杰作，是绝句。毛泽东还提到《为人民服务》年司马迁的名言：“死是人固有的，或重于泰山，或轻于鸿毛。”。”郭沫若甚至欣赏司马迁的才华。他为司马迁祠题词说：“文章旷达，卓尔不群”，“立功追父”。但翦伯赞认为司马迁是中国史学的奠基人。
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