由于乙蒜素独特的杀菌机理，被用于防治多种病害，对常见的细菌性病害、真菌性病害和病毒病均有不错的防效。
1、真菌性病害，花生根腐病、茎基腐病，水稻恶苗病，葡萄、瓜类霜霉病，辣椒疫病，果树腐烂病等。
2、细菌性病害，西兰花黑腐病，大葱、白菜软腐病，草莓枯萎病，花生青枯病等。
3、病毒病，烟草、辣椒等茄科作物黄花叶病毒病，小麦花叶病毒病等。
改善须知
1、防治土传性病害：15%乙蒜素+5%恶霉灵可湿性粉剂灌根或喷雾，成本低，效果好。
2、治疗霜霉病、疫病：80%乙蒜素+50%烯酰吗啉水分散颗粒，发病初期能够迅速控制霜霉病。最明显的效果就是霉层快速变干。
3、治疗枯萎病：80%乙蒜素+霜霉威盐酸盐，灌根，效果比用单剂好很多。