可以扣工资，如果给用人单位造成了损失，还要承担赔偿责任。
一、员工主动离职会扣工资吗？
可能会扣工资。
但《劳动法》规定员工在离职前应提前一个月向公司提交辞呈，以便公司找到接替工作者，若未提交辞呈的，离职后应赔付引起理智给公司带来的损失。扣发工资不明不白，难以得到支持，何况现在国家对扣发工资较敏感。
二、离职要提前多少天告知公司？
提前3天通知公司即可。在试用期离职，根据《劳动法》提前3天通知公司即可。或者用人单位与劳动者协商一致，可以直接解除劳动合同，并且用人单位应该在解除劳动合同时一次性付清劳动者的工资。
劳动者解除劳动合同，应当提前30日以书面形式通知用人单位，明确赋予了职工辞职的权利，这种权利是绝对的，劳动者单方面解除劳动合同无须任何实质条件，只需要履行提前通知的义务(即提前30日书面通知用人单位)即可。
三、离职的程序是什么？
辞职离职的一般程序：
1、提前1个月提交辞职请求;
2、员工主管与辞职员工积极沟通;
3、辞职申请表经各级领导签署意见审批;
4、员工辞职申请获准，办理离职移交手续。
用人单位应当在解除或者终止劳动合同时出具解除或者终止劳动合同的证明，并在十五日内为劳动者办理档案和社会保险关系转移手续。
劳动者应当按照双方约定，办理工作交接。用人单位依照本法有关规定应当向劳动者支付经济补偿的，在办结工作交接时支付。
四、离职之后公积金可以提取出来吗？
离职后公积金账户必须是封存状态才能提取,一般公司在员工离职后一个月内会办理该账户的封存,所以离职后一个月左右去提取比较合适。国家规定，职工账户封存期间，除不具备申请住房公积金贷款资格外，仍享有提取、对账、查询、投诉等相关权利。
综上所述员工主动离职可能会被扣工资，这要看具体的情况而定。如果员工要离职的话应该提前30天的时间向公司说明，如果是在试用期的话就提前3天时间。离职之后的公积金是可以提取出来的，一般是在离职之后的一个月时间之后进行提取的。
法律依据：《中华人民共和国劳动合同法》第九十条劳动者违反本法规定解除劳动合同，或者违反劳动合同中约定的保密义务或者竞业限制，给用人单位造成损失的，应当承担赔偿责任。
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