南京林业大学化学工程学院提供了一系列丰富的本科专业，涵盖了林产化工、轻化工程（包括制浆造纸工艺和制浆造纸装备与控制方向）、化学工程与工艺（精细化工、生物资源化学与工程和化工过程与控制方向）、生物工程（生物化工和微生物制药方向）、环境工程、印刷工程以及生物高分子工程等专业领域。其中，轻化工程（制浆造纸）和林产化工专业更是备受瞩目，分别被评为江苏省品牌专业和特色专业。
学院在学科建设上成绩斐然，林产化学加工工程学科早在1989年和2002年就两度荣膺国家级重点学科。学院的研究实力进一步提升，拥有林业工程（林产化工二级学科）博士后流动站，以及四个博士学位授权点，分别是林产化学加工工程、制浆造纸工程、植物纤维化学与工程和生物质能源科学与技术。同时，学院还设有七个硕士学位授权点，包括上述博士点及环境工程、化学工艺等专业。
学院设施完备，设有“林产化学加工”部级重点开放实验室，以及服务于校内外的现代分析测试中心。此外，学院还设有林产化工、制浆造纸和生物化工三个专门的研究机构，为教学和科研活动提供了强大的支持。
南京林业大学化学工程学院的前身可以追溯到1929年和1933年，由著名林学家、教育家、新中国首任林业部部长梁希先生先后在浙江大学和中央大学创办的森林化学室。1952年，由南京大学（原中央大学）和金陵大学两所高校的森林系合并组建南京林学院（现南京林业大学），并以森林化学室为基础设置了林产化学加工专业。1959年成立林产化学工程系，1993年更名为化学工程学院。