邓石如的篆书，峭拔遒劲，肉腴血畅，圆润相兼；在结构上，变秦篆偏方结体为狭长，改上下均匀为上紧下松，疏可走马，密不透风；在用笔上，以隶法作篆，铺毫直行，裹锋而转，杀锋以取劲折，具有非常明显的提按起倒变化，一改数百年来截毫写篆以求平整的传统。为此，后人对之评价甚高，康有为称其为“集篆之大成”、“篆法之有邓石如，犹儒家有孟子”，后世作篆者，莫不尊邓为典范。邓石如对他的隶书非常自信，自称：“吾篆未及阳冰，丽分不减梁鹄。”邓氏作隶，喜以篆法为之，杂以魏碑笔意，打破传统隶书于字法、笔法和章法上长期不变的定式。其隶书体方笔圆，遵丽淳质；笔画转折处，多有篆意，圆活流畅；章法布局上，纵向结体，横向取势，开张纵逸．豪迈洒脱。邓石如的隶书能够从举世描摹汉碑形貌中脱颖而出，透过刀刻墨拓的掩盖和经久风化的侵蚀来发掘汉隶的精神所在，于后世具有独开气象的意义。
此外，邓石如还擅长楷书和行草书。他的楷书得力于北朝碑志刻石一路，点画饱满丰厚，结体工整沉稳，下笔斩钉截铁，收笔多用出锋，有踔厉风发之势。其行草则常以篆隶、魏碑笔意为之，用笔翻飞绞转，气势磅礴，变化多端，所不足之处在于略逊虚和遵丽，故包世臣云：“尚留片席，使后来者自择所处。”
邓石如传世作品颇多，有《文轴》、《七言诗轴》、《游五园诗轴》、《白氏草堂记》、《文心雕龙轴》、《宋敖陶孙评隶书屏》、《周铭横披》、《海为龙世界联》、《沧海三十七字联》等。