缺勤只会扣基本工资。
1、工作人员请事假全年累计未超过20天或一次性事假未超过15天(不含公休节假日，下同)的，原工资照发。
2、工作人员请事假全年累计超过20天或一次性事假超过15天的，其超过天数的工资按本人基本工资的70计发。
3、工作人员请事假全年累计超过30天的，其超过天数的工资按本人基本工资的50计发。
4、工作人员全年事假累计超过60天的，超过天数停发本人全部工资。
根据我国相关规定，当事人由于请事假，应扣除的工资是月工资除以21.75，乘以本月缺勤天数(扣减法);而本月应得工资是，月工资收入除以21.75，乘以本月出勤天数(累加法)。扣减法和累加法计算工资都是合法的，但一般的操作是出勤天数少，不宜用扣减法计算薪资，一般累加法计算薪资;出勤天数多，缺勤天数少，一般不用累加法算薪资，就用扣减法计算薪资，这样可避免出现极端不符合常理的情况。
法律依据:《中华人民共和国劳动法》
第三条 劳动者享有平等就业和选择职业的权利、取得劳动报酬的权利、休息休假的权利、获得劳动安全卫生保护的权利、接受职业技能培训的权利、享受社会保险和福利的权利、提请劳动争议处理的权利以及法律规定的其他劳动权利。
劳动者应当完成劳动任务，提高职业技能，执行劳动安全卫生规程，遵守劳动纪律和职业道德。
第四条 用人单位应当依法建立和完善规章制度，保障劳动者享有劳动权利和履行劳动义务。
《劳动法》
第五十一条的规定，法定节假日用人单位应当依法支付工资，即折算日工资、小时工资时不剔除国家规定的11天法定节假日。据此，日工资、小时工资的折算为:
日工资:月工资收入÷月计薪天数
小时工资:月工资收入÷(月计薪天数x8小时)。
月计薪天数=(365天-104天)÷12月=21.75天。
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