南京的三甲医院包括：
1. 南京市第一医院
2. 南京市鼓楼医院
3. 江苏省人民医院江苏大学附属医院
4. 南京医科大学附属医院
以下是相关解释：
南京市三甲医院简介：
南京市作为江苏省的省会城市，拥有多家三甲医院，为市民提供高质量的医疗服务。这些医院在医疗技术、设备、医疗服务等方面均达到国家标准。
1. 南京市第一医院：该医院是一家综合性三甲医院，设有多个重点科室，尤其在心血管、神经疾病等方面具有较高的诊治水平。
2. 南京市鼓楼医院：作为南京市知名的医疗机构，鼓楼医院在多个医疗领域都具有较高的声誉，提供全面的医疗服务。
3. 江苏省人民医院江苏大学附属医院：该医院是江苏省的旗舰医院之一，集医疗、科研、教学于一体，拥有先进的医疗设备和一支经验丰富的医疗团队。
4. 南京医科大学附属医院：南京医科大学附属医院也是一所集医疗、教学、科研于一体的三甲医院，与南京医科大学紧密合作，为市民提供高质量的医疗服务。
以上这些医院都是南京市内知名的三甲医院，市民可以根据自身需求选择合适的医疗机构进行就诊。