集体土地使用权的合法转让方式如下：
1、原则上来说作为集体用地只能转让给本集体成员，且不可以转让用于非农业建设。
集体土地使用权在集体组织内部可以通过转包、转让、互换、出租、入股、拍卖等形式自由转让；
2、通过走批准途径实现集体土地使用权的转让。
经村民会议三分之二以上成员或者三分之二以上村民代表的同意，并报乡（镇）人民政府和县级人民政府农业行政主管部门批准；
3、直接变更土地性质使其得以自由转让。
农民集体土地的使用权，原则上不允许出让、转让或者出租用于非农业建设，有两种情形例外，一是国家征收、征用后改为划拨用地，该国有土地的使用权可有偿出让。二是对于符合土地利用总体规划并依法取得建设用地的企业，因破产、兼并等原因使土地使用权发生转移的情形。
集体土地流转的程序：
1、向土地流出方向的村民小组或村民委员会提出申请并填写流转申请书，内容包括：姓名、村名、面积、地名、地类、价格、期限、联系电话等，由村流转信息员向乡（镇）土地流转服务站报送；
2、向土地流入方向乡（镇）土地流转服务站提出申请并填写土地流转申请表，内容包括：姓名、单位、需求面积、地类要求、意向流转期限、拟从事经营项目、联系电话。由乡（镇）土地流转服务站办理并向县土地流转服务中心备案。
综上所述，集体土地流转的主要方式为土地互换、出租、转包、借用、转让等方式，主要发生在集体组织之间，需要由相关的政府部门进行审批或备案。构建和规范农村集体建设用地的流转机制，可以使农民更充分地参与分享城市化、工业化的成果，显化集体土地资产价值，促进农民获得财产性增收。
【法律依据】：
《中华人民共和国土地管理法》第六十三条
土地利用总体规划、城乡规划确定为工业、商业等经营性用途，并经依法登记的集体经营性建设用地，土地所有权人可以通过出让、出租等方式交由单位或者个人使用，并应当签订书面合同，载明土地界址、面积、动工期限、使用期限、土地用途、规划条件和双方其他权利义务。
前款规定的集体经营性建设用地出让、出租等，应当经本集体经济组织成员的村民会议三分之二以上成员或者三分之二以上村民代表的同意。
通过出让等方式取得的集体经营性建设用地使用权可以转让、互换、出资、赠与或者抵押，但法律、行政法规另有规定或者土地所有权人、土地使用权人签订的书面合同另有约定的除外。
集体经营性建设用地的出租，集体建设用地使用权的出让及其最高年限、转让、互换、出资、赠与、抵押等，参照同类用途的国有建设用地执行。具体办法由国务院制定。
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