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1．有些建设项目未严格按河道主管部门批复的要求实施, 2．管理机构层次多，审查手续繁琐, 3．部分流域规划滞后，影响建设项目的审查; 4大部分建设项目的修建都会对河道（堤防）产生一定影响 , 建设必然要壅高上游水位，但允许壅高多少、采取何种补救措施均无统一标准，给建设项目审查带来一定难度。5洪水影响评价工作尚未规范
1加大宣传力度，强化依法管理应加强水法规宣传.2实行防洪抵押金制度防洪抵押金是建设单位保证按批复要求建设的一种承诺。3规范审查程序，明确各级管理单位的责任进一步规范审查程序4抓紧编制流域综合规划及相关专业规划有关规划部门应按照《规定》《防洪法》的要求完成江河流域综合规划、岸线规划等的编制，使河道管理范围内建设项目管理有章可, 5．制定建设项目防洪影响评价规范及建设项目对河道影响的标准针对目前已开展的防洪影响评价工作中存在的不规范问题制定统一的《建设项目防洪影响评价规范》，对建设项目防洪影响评价的目的、要求、范围、内容、编制格式、评审、资质等作出具体规定。同时由于建设项目对河道会产生影响，还应对各种河道管理范围内的建设项目分别制定影响的标准及补救的原则。
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