吉林大学农学部植物科学学院提供了一系列专业供学生选择，包括：
1. 生物技术（植物）专业：这个专业结合生命科学与工程科学，注重理论与实践的结合。学生将学习生物化学、分子生物学等基础知识，通过研究药用植物与生物技术的结合，探索药用植物的离体培养和活性成分开发，为植物资源开发利用提供科学依据，成为生命科学研究的热门方向。
主干课程：生物化学、分子生物学、微生物学等。
就业方向：毕业后可在高校、科研机构或生物制药公司等工作，也可进一步深造生物学相关研究生。
2. 农学专业：旨在培养具备农学基础和现代技术的高级复合型人才，课程涵盖了传统与现代作物遗传学、育种学等内容，学生将学习农业生态科学等理论知识，具备作物生产和育种能力。
主干课程：植物学、遗传学、育种学等。
就业方向：毕业生可从事教学、科研、管理和贸易工作，或继续攻读研究生。
3. 园艺专业：注重理论与实践结合，培养全面的园艺人才，包括蔬菜学、果树学等方向，学生将掌握园艺作物栽培和病虫害防治等技能。
主干课程：植物生物化学、园艺植物病理学等。
就业方向：毕业生可在科研院所、企事业单位等从事园艺工作，也可进一步深造。
4. 植物保护专业：致力于培养具有创新精神和国际视野的植物保护专业人才，涉及病虫防治、经营与管理等方面。
主干课程：植物学、植物病理学等。
就业方向：毕业生可在植物保护、农药化工等领域从事研究和管理工作，或继续攻读相关专业研究生。
5. 农业资源与环境专业：培养具备农业资源高效利用和环境保护知识的高级技术人才，学习土壤学、环境科学等理论。
主干课程：土壤学、植物营养学、环境监测等。
就业方向：毕业生可从事科学研究、教学、管理等工作，或继续深造相关硕士研究生。
吉林大学植物科学学院的前身是原中国人民解放军军需大学农副业生产系，2004年8月原军需大学移交教育部管理，与吉林大学合并后整合优势学科组建而成。