劳动合同不续签违法计算工资的方式是按正常工资发放，除此之外还应赔偿经济补偿金。但用人单位维持或者提高劳动合同约定条件续订劳动合同，劳动者不同意续订的情形除外。经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。
《关于确立劳动关系有关事项的通知》第二条 用人单位未与劳动者签订劳动合同，认定双方存在劳动关系时可参照下列凭证： （一）工资支付凭证或记录（职工工资发放花名册）、缴纳各项社会保险费的记录； （二）用人单位向劳动者发放的"工作证"、"服务证"等能够证明身份的证件； （三）劳动者填写的用人单位招工招聘"登记表"、"报名表"等招用记录； （四）考勤记录； （五）其他劳动者的证言等。 其中，（一）、（三）、（四）项的有关凭证由用人单位负举证责任。